Probiyotiklerin sağlık açısından faydaları yalnızca kullanılan türlerle değil aynı zamanda dozajla da yakından bağlantılıdır. Bilimsel araştırmalar, probiyotiklerin bağırsakta ancak yeterli miktarda tüketildiğinde kolonileşebildiğini, çoğalabildiğini ve düzenleyici etkiler gösterebildiğini göstermektedir. Bu onların bağırsak mikrobiyotasını iyileştirmelerine, sindirimi ve besin emilimini desteklemelerine veya bağışıklığı güçlendirmelerine olanak tanır. Ancak etkili doz suşa bağlı olarak değişir. Örneğin, bazı türler günlük sadece birkaç yüz milyon canlı hücre alımıyla olumlu etkiler yaratabilirken, diğerleri gözle görülür faydalar elde etmek için daha yüksek miktarlara ihtiyaç duyar.
Aynı suş için, belirli bir aralık dahilinde, daha yüksek bir dozun, daha düşük bir doza göre sağlık açısından önemli faydalar sağlama olasılığı genellikle daha yüksektir. Ancak bu "daha fazlasının her zaman daha iyi olduğu" anlamına gelmez. Önerilen dozun aşılması, etkiyi sürekli olarak artırmaz ve hatta israfa yol açabilir veya bazı durumlarda gastrointestinal rahatsızlık riskini artırabilir.
Üstelik, farklı suşların farklı özellikleri ve etki mekanizmaları olduğundan, bir üründeki canlı hücre sayısını karşılaştırmak, ürünün genel etkinliğini göstermez. Probiyotik etkinliğini değerlendirmenin daha bilimsel bir yolu, yalnızca miktardan ziyade spesifik türü destekleyen klinik kanıtlara başvurmaktır. Tüketiciler, ürünleri seçerken, yüksek dozları veya çok sayıda canlı bakteriyi körü körüne takip etmek yerine, klinik araştırma verileri ve yetkili sertifikasyona sahip türlere odaklanmalı ve bireysel ihtiyaçlarına uygun olanları seçmelidir.